碧玺的成分为复杂的硅酸盐，比重变化在2.9-3.2之间，其摩氏硬度为7-7.5，折光率在1.624-1.644之间。碧玺原料呈长柱状，柱面有纵纹，晶体的横断面呈弧面三角形，原料很易识别的。与碧玺相似的宝石还有红柱石、透辉石等。
可以根据下面三个特性来辨别碧玺：
第一，碧玺的双折射率大，从台上向下观察可以见到底棱呈明显的双影现象，依此可将碧玺与黄玉、合成尖晶石等分开；
第二，碧玺经常磨成祖母绿型，从平行长的方向经常可见一些管状的包裹物或棉絮物，而在短的方向观察经常发现其颜色变深，这是因为碧玺不同方向对光的吸收不同，利用此特性即可区分一些合成的仿制品。
第三，碧玺具有强的二色性，红色碧玺为红色---粉红色；绿色碧玺为绿色——淡绿色。据此可将绿色碧玺与橄榄石和绿色玻璃、绿色石榴石等区分开。
鉴别关键记住碧玺特征的长柱状及横切面呈弧面三角形；往往具明显的二色性，可见双影。
与碧玺相似的其他水晶还有红柱石、透辉石等，用肉眼区分这些宝石有时仍是很困难的，需要借助折光仪、重液等手段。
